SECUENCIAS DEL GEN BOLA-DRB3.2 DE BOVINOS GUAYMÍ Y GUABALÁ DE PANAMÁ
Resumen
El complejo mayor de histocompatibilidad (CMH) ha sido asociado con caracteres de importancia económica tales como producción de leche, proteína y grasa en leche y con resistencia o susceptibilidad a enfermedades tales como brucelosis, infestación por garrapatas, hemoparásitos y mastitis. El segundo exón del gen BoLA-DRB3 del CMH, es altamente polimórfico y se han reportado 136 alelos que codifican elementos funcionales de restricción, proceso mediante el cual un linfocito puede reconocer un antígeno como propio o extraño. El objetivo de este trabajo fue validar un protocolo de amplificación y secuenciación del segundo exón del gen BoLA-DRB3 en poblaciones bovinas Guaymí y Guabalá para realizar estudios de caracterización en Panamá. Las secuencias obtenidas presentaron identidad con el segundo exón del gen BoLA-DRB3.2 que oscilaron entre 87% y 98%, en cuanto al número de pares de bases (bp), estas oscilaron entre 148 a 239 y valores máximos (MAX SCORE) de entre 165 a 339. Los alelos con mayor frecuencia en la raza Guabalá fueron, *R-73 (21%) y el *1801(14%) y en la raza Guaymí fue el *0101 (38%). En cuanto a los alelos compartidos, se observó que ambas razas comparten los alelos, *0101 y *R-73. Desde el punto de vista de la conservación y uso de la biodiversidad, las razas Guaymí y Guabalá representan una potencial reserva de genes que deben ser estudiados y fomentar su uso dentro de programas donde se requiera mínimo uso de insumos o, dentro de esquemas de cruzamientos donde se requieran animales de alta rusticidad de tipo Bos taurusx Bos taurus.
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Citas
Aida, Y. 2001. Influence of host genetic differences on leukemogenesis induced bovine leukemia virus. AIDS Res Human Retroviruses, 17, S12.
Baltian, L; Ripoli, MV; Sanfilipo, S; Takeshima, S; Aida, Y; Giovambatista, G. 2012. Association between BoLA-DRB3 and somatic cell count in Holstein cattle from Argentina. Mol Biol Rep 39:7215-7220.
Behl, J; Verma, NK; Behl, R; Mukesh, M; Ahlawat, SPS. 2007. Characterization of Genetic Polymorphism of the Bovine Lymphocyte Antigen DRB3.2 Locus in Kankrej Cattle (Bos indicus) (en línea). J. Dairy Sci. 90:2997–3001. Consultado 13 ene. 2013. Disponible en https://doi.org/10.3168/jds.2006-547.
Behl, J; Kumar Verma, N; Behl, R; Sodhi, M. 2009. Genetic Variation of the Major Histocompatibility Complex DRB3.2 Locus in the Native Bos indicus Cattle Breeds. Asian-Aust. J. Anim. Sci. 22(11):1487-1494.
Bolaños, I; Hernández, D; Álvarez, D. 2017. Asociación de los alelos del gen BoLA-DRB3 con la infección natural de Babesia spp. en el ganado criollo Hartón del Valle. Arch. Zootec. 66 (253):113-120.
Castro, GS; Trujillo, EB; Duran, CV. 2006. Polimorfismos del gen BoLA-DRB3 en el bovino sintético colombiano Lucerna y asociación con conteo de células somáticas y mastitis. Rev Col Cienc Pec. 19:3:270-279.
Da Mota, AF; Gabriel, JE; Martínez, ML; Coutinho, LL. 2002. Distribution of bovine lymphocyte antigen (BoLA-DRB3) alleles in Brazilian dairy Gir cattle (Bos indicus). European Journal of Immunogenetics 29:223–227.
Darwin, Y. 2010. Asociación del locus BOLA-DRB3.2 con el virus de la leucosis Bovina en razas criollas y colombianas. Universidad Nacional De Colombia Facultad De Ciencias Agropecuarias Coordinación General De Posgrados Palmira. Tesis de Maestría. p. 101.
Davies, CJ; Andersson, L; Ellis, SA; Hensen, EJ; Lewin, HA; Mikko, S; Muggli-Cockett, NE; Van der Poel, JJ; Russell, GC. 1997. Nomenclature for factors of the BoLA system, 1996: report of the ISAG BoLA Nomenclature Committee. Anim Genetics 28:159-168.
De, S; Singh, RK. 2006. Identification of new MHC-DRB3 alleles from Indian (Bos indicus) cattle. Animal Genetics 37:595-607.
Dietz, AB; Cohen, ND; Timms, L; Kehrli Junior, ME. 1997. Bovine lymphocite antigen class II alleles as risk factors for high somatic cell counts in milk lactating dairy cows. J. Dairy Sci. 80:406-412.
Do Nascimento, CS; Machado, MA; Martínez, ML; Barbosa Da Silva, MVG; Martins, MFG; Campos, AL; Sousa, ALA, Teodoro, RL; Da Silva, RV; Facioni, SEG; Andrade, DAO. 2006. Association of the bovine major histocompatibility complex (BoLA) BoLA-DRB3 gene with fat and protein production and somatic cell score in Brazilian Gyr dairy cattle (Bos indicus). Genetics and Molecular Biology 29(4):641-647.
Esteban, EN; Poli, M; Poiesz, B; Ceriani, C; Dube, S; Gutierrez, S; Dolcini, G; Gagliardi, R; Perex, S; Lützelschwab, C; Fetdman, L; Juliarena, MA. 2009. Bovine leukemia virus (BLV), proposed control and eradication programs by marker assisted breeding of genetically resistant cattle. In Rechi LJ, editor. Animal Genetics. Hauppauge, NY: Nova Science Publishers, Inc., p. 107-130.
Groenen, M; Van Der Poel, J; R. Dijkhof, R; Giphart, M. 1990. The nucleotide sequence of bovine MHC class II DQB and DRB genes. Immunogenetics 31:37-44.
Hall, TA. 1999. BIOEDIT: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symp Ser 41:95-98.
Hayashi, T; Mekata, H; Sekigushi, S; Kirino, Y; Mitoma, S; Homkawa, K; Horii, Y; Noerimine, J. 2017. Cattle with the BoLA class II DRB3*0902 allele have significantly lower bovine leukemia proviral loads. J. Vet. Med. Sci. 79(9):1552-1555.
Hernández, D; Posso, A; Muñoz, J; Giovambattista, G; Álvarez, L. 2011. Evaluación de la resistencia genética del ganado criollo Hartón del Valle al virus de la leucosis bovina. AICA 1:169-172.
Juliarena, MA; Poli, M; Sala, L; Ceriani, C; Gutiérrez, S., Dolcini, G., Rodríguez, EM; Mariño, B; Rodríguez-Dubra, C; Esteban, EN. 2008. Association of BLV infection profiles with alleles of the BoLA-DRB3.2 gen. Animal Genetics 39:432-438.
Juliarena, MA; Barrios, CA; Lützelschwab, CA; Esteban, EE; Gutiérrez, SE. 2017. Bovine leukemia virus: current perspectives. Virus Adaptation and Treatment 9:13-26.
Kumar, S; Stecher, G; Tamura, K. 2015. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0. Molecular Biology and Evolution.
Lewin, HA; Wu, MC; Stewart, JA; Nolan, TJ. 1988. Association between BoLA and subclinical bovine leukemia virus infection in a herd of Holstein-Friesian cows. Immunogenetic 27:338-344.
Maccari, G; Robinson, J; Ballingall, K; Guethlein, LA; Grimholt, U; Kaufman, J; Ho, CS; De Groot, NG; Flicek, P; Bontrop, RE; Hammond, JA; Marsh, SGE. 2017. IPD-MHC 2.0: an improved inter-species database for the study of the major histocompatibility complex. Nucleic Acids Res. 45:D860-D864.
Maillard, JC; Renard, C; Chardon, P; Chantal, Y; Bensaid, A. 1999. Characterization of 18 new BoLA-DRB3 alleles. Anim. Genet. 30:200-203.
Maillard, JC; Berthier, D; Chantall, I; Thevenon, S; Sidibé, I; Stachurski, F; Belemsaga, D; Razafindraibe, H; Elsen, JM. 2003. Selection assisted by a BoLA-DR/DQ haplotype against susceptibility to bovine dermatophilosis. Genet. Sel. Evol. 35(Suppl. 1):S193-S200.
Machado, MA; Nascimento, CS; Martínez, ML; Silva, MVGB; Campos, AL; Teodoro, RL; Verneque, RS; Guimarães, SEF. 2005 Associação do loco BoLA-DRB3.2 com produção de leite em bovinos da raça Gir. Arq. Bras. Med. Vet. Zootec. 57(3):380-389.
Mariasegaram, M; Chase Junior; CC; Chaparro, JX; Olson, TA; Brenneman, RA; Niedz, RP. 2007. The slick hair coat locus maps to chromosome 20 in Senepol-derived cattle. Animal Genetics 38(1):54–59.
Martínez, R; Toro, R; Montoya, F; Burbano, M; Tobón, J; Gallego, J; Ariza, F. 2005. Caracterización del locus BoLA-DRB3 en ganado criollo Colombiano y asociación con resistencia a enfermedades. Arch Zootec. 54:349-356.
Martínez, ML; Machado, MA; Nascimento, CS; Silva, MVGB; Teodoro, RL; Furlong, J; Prata, MCA; Campos, AL; Guimarães, MFM; Azevedo, ALS; Pires, MFA; Verneque, RS. 2006. Association of BoLA-DRB3.2 alleles with tick (Boophilus microplus) resistance in cattle. Genetics and Molecular Research 5(3):513-524.
Mosafer, J; Heydarpour, M; Manshad, E; Russell, G; G. E. Sulimova, GE. 2012. Distribution of BoLA-DRB3 Allelic Frequencies and Identification of Two New Alleles in Iranian Buffalo Breed (en línea). The ScientificWorld Journal Volume 2012, Article ID 863024, 6 pages. Consultado 13 ene. 2013. Disponible en http://dx.doi.org/10.1100/2012/863024.
Oprządek, J; Urtnowski, P; Sender, G; Pawlik, A; Łukaszewicz, M. 2012. Frequency of BoLA-DRB3 alleles in Polish Holstein-Friesian cattle. Animal Science Papers and Reports 30(2):91-101. Biochem Genet (2016) 54:194-207.
Nikbakht, G; Ghorbanpour R, A; Esmailnejad, A. 2016. Association of BoLA-DRB3.2 Alleles with BLV Infection Profiles (Persistent Lymphocytosis/Lymphosarcoma) and Lymphocyte Subsets in Iranian Holstein Cattle.
Panei, CJ; Suzuki, K; Echeverría, MG; Serena, MS; Metz, GE; Gonzales, ET. 2009. Association of BoLA-DRB3.2 alleles with resistance and susceptibility to persistent lymphocytosis in BLV infected Cattle Argentina. International of Journal of Dairy Science.
Parnian, M; Ali Ghorashi, S; Salehi, A; Pashmi, M; Reza Mollasalehi, M. 2006. Polymorphism of bovine lymphocyte antigen DRB3.2 in Holstein bulls of Iran using PCR-RFLP. IRANIAN Journal of Biotechnology 4(3).
Pashmi, M; Qanbari, S; Ghorashi, SA; Salehi, A. 2007. PCR based RFLP genotyping of bovine lymphocyte antigen DRB3.2 in Iranian Holstein population. Pakistan Journal of Biologucal Science 10(3):383-387.
Paswan, C; Bhushan, B; Patra, BN; Kumar, P; Sharma, A; Dandapat, S; Tomar, AKS; Dutt, T. 2005. Characterization of MHC DRB3.2 Alleles of Crossbred Cattle by Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism. Asian-Aust. J. Anim. Sci. 18(9):1226-1230.
Portillo, M; Ríos Ramírez, JG; Erosa, G; Rodríguez, F. 2006. Secuenciación de nuevos alelos BoLA-DRB3.2 detectados en ganado Criollo mexicano. Téc Pecu Méx. 44(1):15-25.
Posso, AM; Muñoz, J; Giovambattista, G; Álvarez, LA; Hernández, D. 2012. Asociación del gen BoLA-DRB3.2 con el virus de la leucosis bovina (VLB) en ganado criollo hartón del Valle. Acta Agron. 61(5):22-23.
Sadeghi, B; Nassiry, M; Heydarpour, M; Shahroudi, F; Mosafer, J; Motlagh, AS. 2008. Characterization of genetic polymorphism of Bovine Lymphocyte Antigen DRB3.2 Locus in Sistani Cattle of Iran (Bos indicus). Biotechnology 7(2):333-337.
Sigurdardottir, S; Brosch, C; Gustafsson, K; Andersson, L. 1991. Cloning and sequence analysis of 14 DRB alleles of bovine major histocompatibility complex by using the polymerase chain reaction. Animal Genetics 22:199-209.
Takeshima, SN; Aida, Y. 2006. Structure, function and disease susceptibility of the bovine major histocompatibility complex. Anim Sci J. 77:138-150.
Tahmoorespur, M; Nassiry, MR; Najafi, M; Ghovvati, S. 2007. Genetic Polymorphism at the Candidate Gene in Iranian Sistani Cattle (Bos indicus). Pakistan Journal of Biological Sciences, 10:3368-3373.
Villalobos-Cortés, AI; Martínez, AM; Escobar, C; Vega-Pla, JL; Delgado, JV. 2010. Study of genetic diversity of the Guaymí and Guabalá bovine populations by means of microsatellites. Livestock Science 131:45-51.
Villalobos-Cortés, AI; González-Herrera, RC. 2017. Rendimiento de protocolo de extracción de ADN de bovinos criollos. Ciencia Agropecuaria no. 25:108-117.
Wang, K; Sung, D; Zhang, Y. 2008. Sequencing of 15 new BoLA-DRB3 alleles. Int J Immunogenet. 35(4-5):331-2.
Wang K; Zhang Y; Sun Dong-Xiao. 2008. Analysis of Sequences of BoLA-DRB3 Genes in Chinese Yellow Cattle[J]. Acta Veterinaria Et Zootechnica Sinica 39(7):853-857.
Xu, A; Van Eijk, MJ; Park, C; Lewin, HA. 1993. Polymorphism in BoLA-DRB3 exon 2 correlates with resistance to persistent lymphocytosis caused by bovine leukemia virus. Journal of Immunology 151:6977-6985.
Yoshida, T; Furuta, H; Kondo, Y; Mukoyama, H. 2012. Associa¬tion of BoLA-DRB3 alleles with mastitis resistance and susceptibility in Japanese Holstein cows. Anim Sci J, 83:359-366.
Zambrano, JC; Echeverri, JZ; López, AH. 2009. Asociación de los alelos del gen BoLA DRB3.2 con mastitis clínica y mastitis subclínica en vacas del hato Paysandú de la Universidad Nacional de Colombia1. Rev. Colom. Cien. Pecu. 22(3).
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